Il est responsable de l'élaboration et de la mise en oeuvre de la politique du gouvernement en matière d'administration du territoire (circonscriptions administratives, services locaux, chefferies traditionnelles, associations, libertés publiques, etc.), de la protection civile (prévention et gestion des risques de calamités naturelles, coordination des actions nationales et internationales en cas de catastrophe naturelle) et du suivi des questions électorales (organisation, gestion et supervision du processus électoral et référendaire). Le MINAT compte en son sein la DPC (Direction de la Protection Civile).